1.AIRの「プロダクト-app.xml」ファイルにある
<!–<visible></visible>–>
のコメントを解除し以下のように変更
<visible>false</visible>
2.メイン.xmlのvisible属性をtrueに設定しておき後は状況に応じてfalseにする。つまりタスクトレイにアイコンのみ表示される
3.1.2両方falseならタスクバーには表示されない
4.ちなみにタスクトレイのアイコンからアプリを表示する場合はnativeWindow.restore();を忘れずに